Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGGBP1Q9UFW8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGGBP1Q9UFW8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGGBP1Q9UFW8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGGBP1Q9UFW8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGGBP1Q9UFW8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGGBP1Q9UFW8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGGBP1Q9UFW8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGGBP1Q9UFW8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGGBP1Q9UFW8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGGBP1Q9UFW8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGGBP1Q9UFW8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGGBP1Q9UFW8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CGGBP1Q9UFW8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGGBP1Q9UFW8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGGBP1Q9UFW8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGGBP1Q9UFW8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGGBP1Q9UFW8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGGBP1Q9UFW8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGGBP1Q9UFW8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGGBP1Q9UFW8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGGBP1Q9UFW8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGGBP1Q9UFW8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGGBP1Q9UFW8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGGBP1Q9UFW8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGGBP1Q9UFW8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGGBP1Q9UFW8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGGBP1Q9UFW8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGGBP1Q9UFW8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CGGBP1Q9UFW8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CGGBP1Q9UFW8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CGGBP1Q9UFW8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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