Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C19orf12Q9NSK7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C19orf12Q9NSK7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C19orf12Q9NSK7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C19orf12Q9NSK7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C19orf12Q9NSK7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C19orf12Q9NSK7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C19orf12Q9NSK7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C19orf12Q9NSK7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C19orf12Q9NSK7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C19orf12Q9NSK7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C19orf12Q9NSK7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C19orf12Q9NSK7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C19orf12Q9NSK7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C19orf12Q9NSK7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C19orf12Q9NSK7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C19orf12Q9NSK7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C19orf12Q9NSK7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C19orf12Q9NSK7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C19orf12Q9NSK7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf12Q9NSK7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf12Q9NSK7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf12Q9NSK7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf12Q9NSK7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf12Q9NSK7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf12Q9NSK7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf12Q9NSK7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf12Q9NSK7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf12Q9NSK7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf12Q9NSK7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf12Q9NSK7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C19orf12Q9NSK7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf12Q9NSK7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms