Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLE4Q9NR33 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLE4Q9NR33 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLE4Q9NR33 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLE4Q9NR33 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLE4Q9NR33 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLE4Q9NR33 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLE4Q9NR33 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLE4Q9NR33 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLE4Q9NR33 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLE4Q9NR33 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLE4Q9NR33 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLE4Q9NR33 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLE4Q9NR33 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLE4Q9NR33 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLE4Q9NR33 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLE4Q9NR33 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLE4Q9NR33 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLE4Q9NR33 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLE4Q9NR33 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLE4Q9NR33 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLE4Q9NR33 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLE4Q9NR33 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLE4Q9NR33 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLE4Q9NR33 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLE4Q9NR33 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLE4Q9NR33 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLE4Q9NR33 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLE4Q9NR33 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLE4Q9NR33 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLE4Q9NR33 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLE4Q9NR33 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLE4Q9NR33 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLE4Q9NR33 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLE4Q9NR33 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLE4Q9NR33 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLE4Q9NR33 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLE4Q9NR33 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLE4Q9NR33 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLE4Q9NR33 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLE4Q9NR33 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLE4Q9NR33 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLE4Q9NR33 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLE4Q9NR33 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLE4Q9NR33 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLE4Q9NR33 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLE4Q9NR33 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLE4Q9NR33 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLE4Q9NR33 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLE4Q9NR33 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLE4Q9NR33 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLE4Q9NR33 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLE4Q9NR33 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLE4Q9NR33 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLE4Q9NR33 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms