Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACSS2Q9NR19 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACSS2Q9NR19 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACSS2Q9NR19 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACSS2Q9NR19 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACSS2Q9NR19 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACSS2Q9NR19 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACSS2Q9NR19 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACSS2Q9NR19 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACSS2Q9NR19 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ACSS2Q9NR19 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACSS2Q9NR19 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACSS2Q9NR19 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACSS2Q9NR19 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACSS2Q9NR19 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACSS2Q9NR19 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACSS2Q9NR19 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ACSS2Q9NR19 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACSS2Q9NR19 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACSS2Q9NR19 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACSS2Q9NR19 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACSS2Q9NR19 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACSS2Q9NR19 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACSS2Q9NR19 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACSS2Q9NR19 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACSS2Q9NR19 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACSS2Q9NR19 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ACSS2Q9NR19 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACSS2Q9NR19 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACSS2Q9NR19 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACSS2Q9NR19 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACSS2Q9NR19 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACSS2Q9NR19 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACSS2Q9NR19 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACSS2Q9NR19 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACSS2Q9NR19 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACSS2Q9NR19 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACSS2Q9NR19 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACSS2Q9NR19 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACSS2Q9NR19 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACSS2Q9NR19 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACSS2Q9NR19 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACSS2Q9NR19 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACSS2Q9NR19 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACSS2Q9NR19 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACSS2Q9NR19 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACSS2Q9NR19 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACSS2Q9NR19 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ACSS2Q9NR19 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACSS2Q9NR19 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACSS2Q9NR19 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACSS2Q9NR19 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ACSS2Q9NR19 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ACSS2Q9NR19 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACSS2Q9NR19 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACSS2Q9NR19 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACSS2Q9NR19 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACSS2Q9NR19 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ACSS2Q9NR19 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACSS2Q9NR19 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACSS2Q9NR19 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACSS2Q9NR19 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACSS2Q9NR19 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSS2Q9NR19 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSS2Q9NR19 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSS2Q9NR19 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSS2Q9NR19 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSS2Q9NR19 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSS2Q9NR19 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACSS2Q9NR19 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACSS2Q9NR19 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACSS2Q9NR19 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACSS2Q9NR19 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACSS2Q9NR19 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSS2Q9NR19 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSS2Q9NR19 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSS2Q9NR19 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSS2Q9NR19 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSS2Q9NR19 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ACSS2Q9NR19 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms