Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

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Length 1,180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP13A2Q9NQ11 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP13A2Q9NQ11 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP13A2Q9NQ11 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP13A2Q9NQ11 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP13A2Q9NQ11 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP13A2Q9NQ11 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A2Q9NQ11 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A2Q9NQ11 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP13A2Q9NQ11 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP13A2Q9NQ11 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP13A2Q9NQ11 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A2Q9NQ11 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A2Q9NQ11 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A2Q9NQ11 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A2Q9NQ11 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A2Q9NQ11 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A2Q9NQ11 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A2Q9NQ11 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP13A2Q9NQ11 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP13A2Q9NQ11 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP13A2Q9NQ11 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP13A2Q9NQ11 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP13A2Q9NQ11 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP13A2Q9NQ11 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP13A2Q9NQ11 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A2Q9NQ11 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A2Q9NQ11 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A2Q9NQ11 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP13A2Q9NQ11 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP13A2Q9NQ11 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP13A2Q9NQ11 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP13A2Q9NQ11 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP13A2Q9NQ11 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP13A2Q9NQ11 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP13A2Q9NQ11 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP13A2Q9NQ11 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP13A2Q9NQ11 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
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