Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIMMDC1Q9NPL8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TIMMDC1Q9NPL8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TIMMDC1Q9NPL8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIMMDC1Q9NPL8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIMMDC1Q9NPL8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TIMMDC1Q9NPL8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMMDC1Q9NPL8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMMDC1Q9NPL8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMMDC1Q9NPL8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMMDC1Q9NPL8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIMMDC1Q9NPL8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms