Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRCC1Q9NPI7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRCC1Q9NPI7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRCC1Q9NPI7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRCC1Q9NPI7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRCC1Q9NPI7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRCC1Q9NPI7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRCC1Q9NPI7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRCC1Q9NPI7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRCC1Q9NPI7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRCC1Q9NPI7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRCC1Q9NPI7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRCC1Q9NPI7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRCC1Q9NPI7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRCC1Q9NPI7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRCC1Q9NPI7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRCC1Q9NPI7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRCC1Q9NPI7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRCC1Q9NPI7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRCC1Q9NPI7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRCC1Q9NPI7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRCC1Q9NPI7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRCC1Q9NPI7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRCC1Q9NPI7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRCC1Q9NPI7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRCC1Q9NPI7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRCC1Q9NPI7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRCC1Q9NPI7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRCC1Q9NPI7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRCC1Q9NPI7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRCC1Q9NPI7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRCC1Q9NPI7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRCC1Q9NPI7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRCC1Q9NPI7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRCC1Q9NPI7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRCC1Q9NPI7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRCC1Q9NPI7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRCC1Q9NPI7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRCC1Q9NPI7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRCC1Q9NPI7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRCC1Q9NPI7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRCC1Q9NPI7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRCC1Q9NPI7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRCC1Q9NPI7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRCC1Q9NPI7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRCC1Q9NPI7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRCC1Q9NPI7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRCC1Q9NPI7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRCC1Q9NPI7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRCC1Q9NPI7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRCC1Q9NPI7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRCC1Q9NPI7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRCC1Q9NPI7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRCC1Q9NPI7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRCC1Q9NPI7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRCC1Q9NPI7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRCC1Q9NPI7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRCC1Q9NPI7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRCC1Q9NPI7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRCC1Q9NPI7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRCC1Q9NPI7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRCC1Q9NPI7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRCC1Q9NPI7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRCC1Q9NPI7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRCC1Q9NPI7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms