Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST11Q9NPF2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST11Q9NPF2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST11Q9NPF2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST11Q9NPF2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST11Q9NPF2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST11Q9NPF2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST11Q9NPF2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST11Q9NPF2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST11Q9NPF2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST11Q9NPF2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST11Q9NPF2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST11Q9NPF2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST11Q9NPF2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST11Q9NPF2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST11Q9NPF2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHST11Q9NPF2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHST11Q9NPF2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST11Q9NPF2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST11Q9NPF2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST11Q9NPF2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST11Q9NPF2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST11Q9NPF2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST11Q9NPF2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST11Q9NPF2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST11Q9NPF2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST11Q9NPF2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST11Q9NPF2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST11Q9NPF2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST11Q9NPF2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHST11Q9NPF2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHST11Q9NPF2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST11Q9NPF2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST11Q9NPF2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST11Q9NPF2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST11Q9NPF2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST11Q9NPF2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHST11Q9NPF2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST11Q9NPF2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST11Q9NPF2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST11Q9NPF2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST11Q9NPF2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST11Q9NPF2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST11Q9NPF2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST11Q9NPF2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST11Q9NPF2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST11Q9NPF2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST11Q9NPF2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST11Q9NPF2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHST11Q9NPF2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHST11Q9NPF2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST11Q9NPF2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST11Q9NPF2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHST11Q9NPF2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHST11Q9NPF2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHST11Q9NPF2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHST11Q9NPF2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHST11Q9NPF2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHST11Q9NPF2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHST11Q9NPF2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CHST11Q9NPF2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST11Q9NPF2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHST11Q9NPF2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHST11Q9NPF2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHST11Q9NPF2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHST11Q9NPF2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHST11Q9NPF2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHST11Q9NPF2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHST11Q9NPF2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHST11Q9NPF2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHST11Q9NPF2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHST11Q9NPF2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms