Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH0

RHOF, Rho-related GTP-binding protein RhoF, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOFQ9HBH0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOFQ9HBH0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RHOFQ9HBH0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOFQ9HBH0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOFQ9HBH0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOFQ9HBH0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOFQ9HBH0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOFQ9HBH0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOFQ9HBH0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOFQ9HBH0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOFQ9HBH0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOFQ9HBH0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOFQ9HBH0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOFQ9HBH0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOFQ9HBH0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOFQ9HBH0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOFQ9HBH0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOFQ9HBH0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOFQ9HBH0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOFQ9HBH0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOFQ9HBH0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOFQ9HBH0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOFQ9HBH0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOFQ9HBH0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOFQ9HBH0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOFQ9HBH0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOFQ9HBH0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOFQ9HBH0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOFQ9HBH0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOFQ9HBH0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms