Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRPEL1Q9HAV7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRPEL1Q9HAV7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRPEL1Q9HAV7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRPEL1Q9HAV7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRPEL1Q9HAV7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRPEL1Q9HAV7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRPEL1Q9HAV7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRPEL1Q9HAV7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRPEL1Q9HAV7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRPEL1Q9HAV7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRPEL1Q9HAV7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRPEL1Q9HAV7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRPEL1Q9HAV7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
GRPEL1Q9HAV7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
GRPEL1Q9HAV7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRPEL1Q9HAV7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRPEL1Q9HAV7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRPEL1Q9HAV7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRPEL1Q9HAV7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRPEL1Q9HAV7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRPEL1Q9HAV7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRPEL1Q9HAV7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRPEL1Q9HAV7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRPEL1Q9HAV7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRPEL1Q9HAV7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRPEL1Q9HAV7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRPEL1Q9HAV7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRPEL1Q9HAV7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRPEL1Q9HAV7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRPEL1Q9HAV7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRPEL1Q9HAV7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRPEL1Q9HAV7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRPEL1Q9HAV7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRPEL1Q9HAV7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRPEL1Q9HAV7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRPEL1Q9HAV7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRPEL1Q9HAV7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRPEL1Q9HAV7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRPEL1Q9HAV7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRPEL1Q9HAV7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRPEL1Q9HAV7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRPEL1Q9HAV7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRPEL1Q9HAV7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRPEL1Q9HAV7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRPEL1Q9HAV7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRPEL1Q9HAV7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRPEL1Q9HAV7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GRPEL1Q9HAV7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRPEL1Q9HAV7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRPEL1Q9HAV7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRPEL1Q9HAV7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRPEL1Q9HAV7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRPEL1Q9HAV7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRPEL1Q9HAV7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRPEL1Q9HAV7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRPEL1Q9HAV7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRPEL1Q9HAV7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRPEL1Q9HAV7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRPEL1Q9HAV7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRPEL1Q9HAV7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRPEL1Q9HAV7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRPEL1Q9HAV7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRPEL1Q9HAV7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRPEL1Q9HAV7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRPEL1Q9HAV7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRPEL1Q9HAV7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRPEL1Q9HAV7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRPEL1Q9HAV7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
GRPEL1Q9HAV7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRPEL1Q9HAV7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRPEL1Q9HAV7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRPEL1Q9HAV7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRPEL1Q9HAV7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRPEL1Q9HAV7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRPEL1Q9HAV7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRPEL1Q9HAV7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRPEL1Q9HAV7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRPEL1Q9HAV7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRPEL1Q9HAV7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRPEL1Q9HAV7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRPEL1Q9HAV7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GRPEL1Q9HAV7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRPEL1Q9HAV7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRPEL1Q9HAV7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRPEL1Q9HAV7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRPEL1Q9HAV7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRPEL1Q9HAV7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRPEL1Q9HAV7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRPEL1Q9HAV7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRPEL1Q9HAV7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
GRPEL1Q9HAV7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRPEL1Q9HAV7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRPEL1Q9HAV7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRPEL1Q9HAV7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRPEL1Q9HAV7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRPEL1Q9HAV7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRPEL1Q9HAV7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRPEL1Q9HAV7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRPEL1Q9HAV7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms