Protein–RNA interactions for Protein: Q9H987

SYNPO2L, Synaptopodin 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2LQ9H987 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNPO2LQ9H987 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNPO2LQ9H987 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNPO2LQ9H987 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNPO2LQ9H987 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNPO2LQ9H987 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNPO2LQ9H987 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNPO2LQ9H987 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNPO2LQ9H987 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNPO2LQ9H987 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNPO2LQ9H987 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNPO2LQ9H987 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNPO2LQ9H987 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNPO2LQ9H987 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNPO2LQ9H987 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNPO2LQ9H987 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNPO2LQ9H987 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNPO2LQ9H987 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNPO2LQ9H987 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNPO2LQ9H987 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNPO2LQ9H987 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNPO2LQ9H987 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNPO2LQ9H987 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNPO2LQ9H987 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNPO2LQ9H987 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNPO2LQ9H987 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNPO2LQ9H987 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNPO2LQ9H987 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNPO2LQ9H987 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNPO2LQ9H987 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNPO2LQ9H987 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNPO2LQ9H987 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNPO2LQ9H987 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNPO2LQ9H987 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNPO2LQ9H987 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNPO2LQ9H987 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNPO2LQ9H987 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNPO2LQ9H987 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNPO2LQ9H987 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNPO2LQ9H987 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNPO2LQ9H987 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNPO2LQ9H987 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNPO2LQ9H987 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNPO2LQ9H987 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNPO2LQ9H987 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNPO2LQ9H987 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNPO2LQ9H987 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNPO2LQ9H987 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNPO2LQ9H987 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNPO2LQ9H987 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNPO2LQ9H987 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNPO2LQ9H987 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNPO2LQ9H987 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNPO2LQ9H987 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNPO2LQ9H987 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNPO2LQ9H987 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNPO2LQ9H987 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNPO2LQ9H987 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNPO2LQ9H987 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNPO2LQ9H987 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms