Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4R4

NCOR1P1, Putative nuclear receptor corepressor 1-like protein NCOR1P1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOR1P1Q9H4R4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOR1P1Q9H4R4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCOR1P1Q9H4R4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCOR1P1Q9H4R4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCOR1P1Q9H4R4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCOR1P1Q9H4R4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms