Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PARLQ9H300 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PARLQ9H300 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PARLQ9H300 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms