Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSX2Q9BZM3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSX2Q9BZM3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GSX2Q9BZM3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSX2Q9BZM3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSX2Q9BZM3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSX2Q9BZM3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSX2Q9BZM3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSX2Q9BZM3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSX2Q9BZM3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSX2Q9BZM3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSX2Q9BZM3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSX2Q9BZM3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSX2Q9BZM3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSX2Q9BZM3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSX2Q9BZM3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSX2Q9BZM3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSX2Q9BZM3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSX2Q9BZM3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSX2Q9BZM3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSX2Q9BZM3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSX2Q9BZM3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSX2Q9BZM3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSX2Q9BZM3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSX2Q9BZM3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GSX2Q9BZM3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSX2Q9BZM3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSX2Q9BZM3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSX2Q9BZM3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSX2Q9BZM3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSX2Q9BZM3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSX2Q9BZM3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSX2Q9BZM3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSX2Q9BZM3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSX2Q9BZM3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSX2Q9BZM3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSX2Q9BZM3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSX2Q9BZM3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSX2Q9BZM3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSX2Q9BZM3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSX2Q9BZM3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSX2Q9BZM3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSX2Q9BZM3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSX2Q9BZM3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSX2Q9BZM3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSX2Q9BZM3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSX2Q9BZM3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSX2Q9BZM3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSX2Q9BZM3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSX2Q9BZM3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSX2Q9BZM3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSX2Q9BZM3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSX2Q9BZM3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSX2Q9BZM3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSX2Q9BZM3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSX2Q9BZM3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSX2Q9BZM3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSX2Q9BZM3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSX2Q9BZM3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSX2Q9BZM3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSX2Q9BZM3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSX2Q9BZM3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSX2Q9BZM3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GSX2Q9BZM3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSX2Q9BZM3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSX2Q9BZM3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms