Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLDIP3Q9BY77 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLDIP3Q9BY77 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLDIP3Q9BY77 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLDIP3Q9BY77 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLDIP3Q9BY77 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLDIP3Q9BY77 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLDIP3Q9BY77 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLDIP3Q9BY77 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLDIP3Q9BY77 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLDIP3Q9BY77 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLDIP3Q9BY77 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLDIP3Q9BY77 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLDIP3Q9BY77 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLDIP3Q9BY77 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POLDIP3Q9BY77 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLDIP3Q9BY77 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLDIP3Q9BY77 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLDIP3Q9BY77 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLDIP3Q9BY77 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLDIP3Q9BY77 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLDIP3Q9BY77 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLDIP3Q9BY77 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLDIP3Q9BY77 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLDIP3Q9BY77 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLDIP3Q9BY77 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLDIP3Q9BY77 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLDIP3Q9BY77 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLDIP3Q9BY77 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLDIP3Q9BY77 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLDIP3Q9BY77 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLDIP3Q9BY77 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLDIP3Q9BY77 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLDIP3Q9BY77 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLDIP3Q9BY77 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLDIP3Q9BY77 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLDIP3Q9BY77 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLDIP3Q9BY77 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLDIP3Q9BY77 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLDIP3Q9BY77 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLDIP3Q9BY77 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLDIP3Q9BY77 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLDIP3Q9BY77 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms