Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA5

SUCNR1, Succinate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCNR1Q9BXA5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCNR1Q9BXA5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCNR1Q9BXA5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCNR1Q9BXA5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCNR1Q9BXA5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCNR1Q9BXA5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCNR1Q9BXA5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCNR1Q9BXA5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUCNR1Q9BXA5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUCNR1Q9BXA5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUCNR1Q9BXA5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUCNR1Q9BXA5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SUCNR1Q9BXA5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUCNR1Q9BXA5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUCNR1Q9BXA5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUCNR1Q9BXA5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCNR1Q9BXA5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SUCNR1Q9BXA5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUCNR1Q9BXA5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCNR1Q9BXA5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCNR1Q9BXA5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUCNR1Q9BXA5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUCNR1Q9BXA5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUCNR1Q9BXA5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUCNR1Q9BXA5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUCNR1Q9BXA5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUCNR1Q9BXA5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUCNR1Q9BXA5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUCNR1Q9BXA5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms