Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNPPD1Q9BV87 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNPPD1Q9BV87 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNPPD1Q9BV87 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNPPD1Q9BV87 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNPPD1Q9BV87 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNPPD1Q9BV87 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNPPD1Q9BV87 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNPPD1Q9BV87 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNPPD1Q9BV87 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNPPD1Q9BV87 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNPPD1Q9BV87 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNPPD1Q9BV87 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNPPD1Q9BV87 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNPPD1Q9BV87 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNPPD1Q9BV87 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNPPD1Q9BV87 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNPPD1Q9BV87 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNPPD1Q9BV87 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNPPD1Q9BV87 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNPPD1Q9BV87 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms