Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMIM7Q9BQ49 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMIM7Q9BQ49 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SMIM7Q9BQ49 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM7Q9BQ49 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM7Q9BQ49 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM7Q9BQ49 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM7Q9BQ49 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM7Q9BQ49 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM7Q9BQ49 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM7Q9BQ49 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM7Q9BQ49 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM7Q9BQ49 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM7Q9BQ49 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM7Q9BQ49 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM7Q9BQ49 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM7Q9BQ49 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM7Q9BQ49 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM7Q9BQ49 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM7Q9BQ49 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM7Q9BQ49 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM7Q9BQ49 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM7Q9BQ49 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM7Q9BQ49 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM7Q9BQ49 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM7Q9BQ49 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM7Q9BQ49 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM7Q9BQ49 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM7Q9BQ49 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM7Q9BQ49 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM7Q9BQ49 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM7Q9BQ49 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM7Q9BQ49 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM7Q9BQ49 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMIM7Q9BQ49 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms