Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALPK1Q96QP1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALPK1Q96QP1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALPK1Q96QP1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALPK1Q96QP1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALPK1Q96QP1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALPK1Q96QP1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALPK1Q96QP1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALPK1Q96QP1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALPK1Q96QP1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALPK1Q96QP1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALPK1Q96QP1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALPK1Q96QP1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALPK1Q96QP1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALPK1Q96QP1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALPK1Q96QP1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALPK1Q96QP1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALPK1Q96QP1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALPK1Q96QP1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALPK1Q96QP1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ALPK1Q96QP1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALPK1Q96QP1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALPK1Q96QP1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALPK1Q96QP1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALPK1Q96QP1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK1Q96QP1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK1Q96QP1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK1Q96QP1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALPK1Q96QP1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALPK1Q96QP1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALPK1Q96QP1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALPK1Q96QP1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALPK1Q96QP1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ALPK1Q96QP1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALPK1Q96QP1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALPK1Q96QP1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALPK1Q96QP1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALPK1Q96QP1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALPK1Q96QP1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALPK1Q96QP1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ALPK1Q96QP1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALPK1Q96QP1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALPK1Q96QP1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALPK1Q96QP1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALPK1Q96QP1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK1Q96QP1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK1Q96QP1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALPK1Q96QP1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK1Q96QP1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK1Q96QP1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK1Q96QP1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK1Q96QP1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALPK1Q96QP1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALPK1Q96QP1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALPK1Q96QP1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALPK1Q96QP1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALPK1Q96QP1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK1Q96QP1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK1Q96QP1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALPK1Q96QP1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALPK1Q96QP1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALPK1Q96QP1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK1Q96QP1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK1Q96QP1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK1Q96QP1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALPK1Q96QP1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALPK1Q96QP1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALPK1Q96QP1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALPK1Q96QP1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK1Q96QP1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK1Q96QP1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALPK1Q96QP1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALPK1Q96QP1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALPK1Q96QP1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALPK1Q96QP1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms