Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNC2Q96PR1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNC2Q96PR1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNC2Q96PR1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNC2Q96PR1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNC2Q96PR1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNC2Q96PR1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNC2Q96PR1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNC2Q96PR1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNC2Q96PR1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNC2Q96PR1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNC2Q96PR1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNC2Q96PR1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNC2Q96PR1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNC2Q96PR1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNC2Q96PR1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNC2Q96PR1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNC2Q96PR1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNC2Q96PR1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNC2Q96PR1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNC2Q96PR1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNC2Q96PR1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNC2Q96PR1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNC2Q96PR1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNC2Q96PR1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNC2Q96PR1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNC2Q96PR1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNC2Q96PR1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNC2Q96PR1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNC2Q96PR1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNC2Q96PR1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNC2Q96PR1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms