Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
YTHDC1Q96MU7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
YTHDC1Q96MU7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
YTHDC1Q96MU7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
YTHDC1Q96MU7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
YTHDC1Q96MU7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
YTHDC1Q96MU7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
YTHDC1Q96MU7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
YTHDC1Q96MU7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
YTHDC1Q96MU7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
YTHDC1Q96MU7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
YTHDC1Q96MU7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
YTHDC1Q96MU7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
YTHDC1Q96MU7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
YTHDC1Q96MU7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
YTHDC1Q96MU7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
YTHDC1Q96MU7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
YTHDC1Q96MU7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
YTHDC1Q96MU7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
YTHDC1Q96MU7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
YTHDC1Q96MU7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
YTHDC1Q96MU7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
YTHDC1Q96MU7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
YTHDC1Q96MU7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
YTHDC1Q96MU7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
YTHDC1Q96MU7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
YTHDC1Q96MU7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
YTHDC1Q96MU7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
YTHDC1Q96MU7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
YTHDC1Q96MU7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
YTHDC1Q96MU7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
YTHDC1Q96MU7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
YTHDC1Q96MU7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
YTHDC1Q96MU7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
YTHDC1Q96MU7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
YTHDC1Q96MU7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
YTHDC1Q96MU7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
YTHDC1Q96MU7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
YTHDC1Q96MU7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
YTHDC1Q96MU7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
YTHDC1Q96MU7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
YTHDC1Q96MU7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
YTHDC1Q96MU7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
YTHDC1Q96MU7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
YTHDC1Q96MU7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
YTHDC1Q96MU7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
YTHDC1Q96MU7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
YTHDC1Q96MU7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
YTHDC1Q96MU7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
YTHDC1Q96MU7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
YTHDC1Q96MU7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
YTHDC1Q96MU7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
YTHDC1Q96MU7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
YTHDC1Q96MU7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
YTHDC1Q96MU7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
YTHDC1Q96MU7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
YTHDC1Q96MU7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
YTHDC1Q96MU7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
YTHDC1Q96MU7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
YTHDC1Q96MU7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
YTHDC1Q96MU7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
YTHDC1Q96MU7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
YTHDC1Q96MU7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
YTHDC1Q96MU7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
YTHDC1Q96MU7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
YTHDC1Q96MU7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
YTHDC1Q96MU7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
YTHDC1Q96MU7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
YTHDC1Q96MU7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
YTHDC1Q96MU7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
YTHDC1Q96MU7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
YTHDC1Q96MU7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
YTHDC1Q96MU7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
YTHDC1Q96MU7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
YTHDC1Q96MU7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
YTHDC1Q96MU7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
YTHDC1Q96MU7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
YTHDC1Q96MU7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
YTHDC1Q96MU7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
YTHDC1Q96MU7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
YTHDC1Q96MU7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
YTHDC1Q96MU7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
YTHDC1Q96MU7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
YTHDC1Q96MU7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
YTHDC1Q96MU7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
YTHDC1Q96MU7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
YTHDC1Q96MU7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
YTHDC1Q96MU7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
YTHDC1Q96MU7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
YTHDC1Q96MU7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
YTHDC1Q96MU7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
YTHDC1Q96MU7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
YTHDC1Q96MU7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
YTHDC1Q96MU7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
YTHDC1Q96MU7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
YTHDC1Q96MU7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
YTHDC1Q96MU7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
YTHDC1Q96MU7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
YTHDC1Q96MU7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
YTHDC1Q96MU7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms