Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSMCE3Q96MG7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSMCE3Q96MG7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSMCE3Q96MG7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSMCE3Q96MG7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSMCE3Q96MG7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NSMCE3Q96MG7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSMCE3Q96MG7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSMCE3Q96MG7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSMCE3Q96MG7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSMCE3Q96MG7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSMCE3Q96MG7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMCE3Q96MG7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMCE3Q96MG7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NSMCE3Q96MG7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NSMCE3Q96MG7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NSMCE3Q96MG7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NSMCE3Q96MG7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NSMCE3Q96MG7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NSMCE3Q96MG7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSMCE3Q96MG7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NSMCE3Q96MG7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSMCE3Q96MG7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSMCE3Q96MG7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSMCE3Q96MG7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NSMCE3Q96MG7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSMCE3Q96MG7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSMCE3Q96MG7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSMCE3Q96MG7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSMCE3Q96MG7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSMCE3Q96MG7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSMCE3Q96MG7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSMCE3Q96MG7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSMCE3Q96MG7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSMCE3Q96MG7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSMCE3Q96MG7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSMCE3Q96MG7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSMCE3Q96MG7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSMCE3Q96MG7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSMCE3Q96MG7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSMCE3Q96MG7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSMCE3Q96MG7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSMCE3Q96MG7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSMCE3Q96MG7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSMCE3Q96MG7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms