Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNBD2Q96M20 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNBD2Q96M20 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNBD2Q96M20 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNBD2Q96M20 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNBD2Q96M20 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNBD2Q96M20 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNBD2Q96M20 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNBD2Q96M20 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNBD2Q96M20 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNBD2Q96M20 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNBD2Q96M20 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNBD2Q96M20 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNBD2Q96M20 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNBD2Q96M20 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNBD2Q96M20 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNBD2Q96M20 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNBD2Q96M20 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNBD2Q96M20 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNBD2Q96M20 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNBD2Q96M20 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNBD2Q96M20 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNBD2Q96M20 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNBD2Q96M20 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNBD2Q96M20 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNBD2Q96M20 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNBD2Q96M20 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNBD2Q96M20 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNBD2Q96M20 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD2Q96M20 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD2Q96M20 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNBD2Q96M20 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNBD2Q96M20 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD2Q96M20 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD2Q96M20 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNBD2Q96M20 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD2Q96M20 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD2Q96M20 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNBD2Q96M20 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNBD2Q96M20 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNBD2Q96M20 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNBD2Q96M20 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNBD2Q96M20 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNBD2Q96M20 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD2Q96M20 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD2Q96M20 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD2Q96M20 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD2Q96M20 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNBD2Q96M20 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNBD2Q96M20 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD2Q96M20 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNBD2Q96M20 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD2Q96M20 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD2Q96M20 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNBD2Q96M20 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD2Q96M20 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD2Q96M20 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNBD2Q96M20 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNBD2Q96M20 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNBD2Q96M20 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNBD2Q96M20 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNBD2Q96M20 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNBD2Q96M20 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNBD2Q96M20 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNBD2Q96M20 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNBD2Q96M20 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNBD2Q96M20 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNBD2Q96M20 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms