Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPGRIP1Q96KN7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPGRIP1Q96KN7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPGRIP1Q96KN7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPGRIP1Q96KN7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPGRIP1Q96KN7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPGRIP1Q96KN7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RPGRIP1Q96KN7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RPGRIP1Q96KN7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPGRIP1Q96KN7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPGRIP1Q96KN7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPGRIP1Q96KN7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPGRIP1Q96KN7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPGRIP1Q96KN7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPGRIP1Q96KN7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RPGRIP1Q96KN7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RPGRIP1Q96KN7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPGRIP1Q96KN7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPGRIP1Q96KN7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPGRIP1Q96KN7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPGRIP1Q96KN7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPGRIP1Q96KN7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPGRIP1Q96KN7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPGRIP1Q96KN7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPGRIP1Q96KN7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPGRIP1Q96KN7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPGRIP1Q96KN7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPGRIP1Q96KN7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPGRIP1Q96KN7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPGRIP1Q96KN7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPGRIP1Q96KN7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPGRIP1Q96KN7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPGRIP1Q96KN7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RPGRIP1Q96KN7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPGRIP1Q96KN7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPGRIP1Q96KN7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPGRIP1Q96KN7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPGRIP1Q96KN7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RPGRIP1Q96KN7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPGRIP1Q96KN7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPGRIP1Q96KN7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPGRIP1Q96KN7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPGRIP1Q96KN7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPGRIP1Q96KN7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPGRIP1Q96KN7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPGRIP1Q96KN7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPGRIP1Q96KN7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPGRIP1Q96KN7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPGRIP1Q96KN7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPGRIP1Q96KN7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPGRIP1Q96KN7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPGRIP1Q96KN7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPGRIP1Q96KN7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RPGRIP1Q96KN7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPGRIP1Q96KN7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPGRIP1Q96KN7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPGRIP1Q96KN7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPGRIP1Q96KN7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPGRIP1Q96KN7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPGRIP1Q96KN7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPGRIP1Q96KN7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPGRIP1Q96KN7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPGRIP1Q96KN7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPGRIP1Q96KN7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPGRIP1Q96KN7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPGRIP1Q96KN7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPGRIP1Q96KN7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPGRIP1Q96KN7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPGRIP1Q96KN7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPGRIP1Q96KN7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPGRIP1Q96KN7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPGRIP1Q96KN7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPGRIP1Q96KN7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPGRIP1Q96KN7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPGRIP1Q96KN7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPGRIP1Q96KN7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPGRIP1Q96KN7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPGRIP1Q96KN7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPGRIP1Q96KN7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPGRIP1Q96KN7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPGRIP1Q96KN7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RPGRIP1Q96KN7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RPGRIP1Q96KN7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPGRIP1Q96KN7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPGRIP1Q96KN7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPGRIP1Q96KN7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPGRIP1Q96KN7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPGRIP1Q96KN7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPGRIP1Q96KN7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPGRIP1Q96KN7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RPGRIP1Q96KN7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPGRIP1Q96KN7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPGRIP1Q96KN7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPGRIP1Q96KN7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPGRIP1Q96KN7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPGRIP1Q96KN7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPGRIP1Q96KN7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPGRIP1Q96KN7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPGRIP1Q96KN7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms