Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SERAC1Q96JX3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SERAC1Q96JX3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SERAC1Q96JX3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SERAC1Q96JX3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SERAC1Q96JX3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SERAC1Q96JX3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SERAC1Q96JX3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SERAC1Q96JX3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SERAC1Q96JX3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SERAC1Q96JX3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SERAC1Q96JX3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SERAC1Q96JX3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SERAC1Q96JX3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SERAC1Q96JX3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SERAC1Q96JX3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SERAC1Q96JX3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SERAC1Q96JX3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SERAC1Q96JX3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SERAC1Q96JX3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SERAC1Q96JX3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SERAC1Q96JX3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SERAC1Q96JX3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SERAC1Q96JX3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SERAC1Q96JX3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SERAC1Q96JX3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SERAC1Q96JX3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SERAC1Q96JX3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SERAC1Q96JX3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SERAC1Q96JX3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SERAC1Q96JX3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SERAC1Q96JX3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SERAC1Q96JX3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SERAC1Q96JX3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SERAC1Q96JX3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SERAC1Q96JX3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SERAC1Q96JX3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SERAC1Q96JX3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SERAC1Q96JX3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SERAC1Q96JX3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SERAC1Q96JX3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SERAC1Q96JX3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SERAC1Q96JX3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SERAC1Q96JX3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SERAC1Q96JX3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SERAC1Q96JX3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SERAC1Q96JX3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SERAC1Q96JX3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SERAC1Q96JX3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SERAC1Q96JX3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SERAC1Q96JX3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SERAC1Q96JX3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SERAC1Q96JX3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SERAC1Q96JX3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SERAC1Q96JX3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SERAC1Q96JX3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SERAC1Q96JX3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SERAC1Q96JX3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SERAC1Q96JX3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SERAC1Q96JX3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERAC1Q96JX3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERAC1Q96JX3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERAC1Q96JX3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SERAC1Q96JX3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SERAC1Q96JX3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SERAC1Q96JX3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SERAC1Q96JX3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SERAC1Q96JX3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SERAC1Q96JX3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SERAC1Q96JX3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SERAC1Q96JX3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SERAC1Q96JX3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SERAC1Q96JX3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SERAC1Q96JX3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SERAC1Q96JX3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SERAC1Q96JX3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SERAC1Q96JX3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SERAC1Q96JX3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SERAC1Q96JX3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SERAC1Q96JX3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SERAC1Q96JX3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SERAC1Q96JX3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SERAC1Q96JX3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SERAC1Q96JX3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SERAC1Q96JX3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SERAC1Q96JX3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SERAC1Q96JX3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SERAC1Q96JX3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SERAC1Q96JX3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SERAC1Q96JX3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SERAC1Q96JX3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SERAC1Q96JX3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms