Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PGBD1Q96JS3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PGBD1Q96JS3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PGBD1Q96JS3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PGBD1Q96JS3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PGBD1Q96JS3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PGBD1Q96JS3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PGBD1Q96JS3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PGBD1Q96JS3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PGBD1Q96JS3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PGBD1Q96JS3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PGBD1Q96JS3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PGBD1Q96JS3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PGBD1Q96JS3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PGBD1Q96JS3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PGBD1Q96JS3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PGBD1Q96JS3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PGBD1Q96JS3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PGBD1Q96JS3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PGBD1Q96JS3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PGBD1Q96JS3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PGBD1Q96JS3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PGBD1Q96JS3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PGBD1Q96JS3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PGBD1Q96JS3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PGBD1Q96JS3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PGBD1Q96JS3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PGBD1Q96JS3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PGBD1Q96JS3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PGBD1Q96JS3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PGBD1Q96JS3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PGBD1Q96JS3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PGBD1Q96JS3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PGBD1Q96JS3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PGBD1Q96JS3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PGBD1Q96JS3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PGBD1Q96JS3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PGBD1Q96JS3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PGBD1Q96JS3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PGBD1Q96JS3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
PGBD1Q96JS3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PGBD1Q96JS3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PGBD1Q96JS3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PGBD1Q96JS3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PGBD1Q96JS3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PGBD1Q96JS3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PGBD1Q96JS3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PGBD1Q96JS3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PGBD1Q96JS3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PGBD1Q96JS3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PGBD1Q96JS3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PGBD1Q96JS3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PGBD1Q96JS3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PGBD1Q96JS3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PGBD1Q96JS3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PGBD1Q96JS3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
PGBD1Q96JS3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PGBD1Q96JS3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PGBD1Q96JS3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms