Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EAF1Q96JC9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EAF1Q96JC9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EAF1Q96JC9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EAF1Q96JC9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EAF1Q96JC9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EAF1Q96JC9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EAF1Q96JC9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EAF1Q96JC9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EAF1Q96JC9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EAF1Q96JC9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms