Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK5RAP3Q96JB5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK5RAP3Q96JB5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK5RAP3Q96JB5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK5RAP3Q96JB5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK5RAP3Q96JB5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK5RAP3Q96JB5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK5RAP3Q96JB5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK5RAP3Q96JB5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK5RAP3Q96JB5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK5RAP3Q96JB5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK5RAP3Q96JB5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK5RAP3Q96JB5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK5RAP3Q96JB5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK5RAP3Q96JB5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK5RAP3Q96JB5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK5RAP3Q96JB5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK5RAP3Q96JB5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK5RAP3Q96JB5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK5RAP3Q96JB5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK5RAP3Q96JB5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK5RAP3Q96JB5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK5RAP3Q96JB5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDK5RAP3Q96JB5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK5RAP3Q96JB5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK5RAP3Q96JB5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK5RAP3Q96JB5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK5RAP3Q96JB5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK5RAP3Q96JB5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK5RAP3Q96JB5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK5RAP3Q96JB5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK5RAP3Q96JB5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK5RAP3Q96JB5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK5RAP3Q96JB5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK5RAP3Q96JB5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK5RAP3Q96JB5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK5RAP3Q96JB5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK5RAP3Q96JB5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK5RAP3Q96JB5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK5RAP3Q96JB5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK5RAP3Q96JB5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK5RAP3Q96JB5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK5RAP3Q96JB5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK5RAP3Q96JB5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK5RAP3Q96JB5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK5RAP3Q96JB5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK5RAP3Q96JB5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK5RAP3Q96JB5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK5RAP3Q96JB5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK5RAP3Q96JB5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK5RAP3Q96JB5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK5RAP3Q96JB5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK5RAP3Q96JB5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK5RAP3Q96JB5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK5RAP3Q96JB5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK5RAP3Q96JB5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK5RAP3Q96JB5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK5RAP3Q96JB5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK5RAP3Q96JB5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK5RAP3Q96JB5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK5RAP3Q96JB5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK5RAP3Q96JB5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK5RAP3Q96JB5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK5RAP3Q96JB5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK5RAP3Q96JB5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms