Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYFIP2Q96F07 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYFIP2Q96F07 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYFIP2Q96F07 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYFIP2Q96F07 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYFIP2Q96F07 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYFIP2Q96F07 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYFIP2Q96F07 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYFIP2Q96F07 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYFIP2Q96F07 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYFIP2Q96F07 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYFIP2Q96F07 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYFIP2Q96F07 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYFIP2Q96F07 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYFIP2Q96F07 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYFIP2Q96F07 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYFIP2Q96F07 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYFIP2Q96F07 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYFIP2Q96F07 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYFIP2Q96F07 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYFIP2Q96F07 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CYFIP2Q96F07 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CYFIP2Q96F07 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYFIP2Q96F07 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYFIP2Q96F07 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CYFIP2Q96F07 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYFIP2Q96F07 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYFIP2Q96F07 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYFIP2Q96F07 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYFIP2Q96F07 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYFIP2Q96F07 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYFIP2Q96F07 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYFIP2Q96F07 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CYFIP2Q96F07 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYFIP2Q96F07 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYFIP2Q96F07 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CYFIP2Q96F07 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYFIP2Q96F07 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYFIP2Q96F07 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYFIP2Q96F07 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYFIP2Q96F07 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CYFIP2Q96F07 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYFIP2Q96F07 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYFIP2Q96F07 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYFIP2Q96F07 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYFIP2Q96F07 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYFIP2Q96F07 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CYFIP2Q96F07 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms