Protein–RNA interactions for Protein: Q96EN9

C19orf60, Uncharacterized protein C19orf60, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf60Q96EN9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
C19orf60Q96EN9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C19orf60Q96EN9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C19orf60Q96EN9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C19orf60Q96EN9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
C19orf60Q96EN9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C19orf60Q96EN9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C19orf60Q96EN9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C19orf60Q96EN9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C19orf60Q96EN9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C19orf60Q96EN9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C19orf60Q96EN9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C19orf60Q96EN9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C19orf60Q96EN9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C19orf60Q96EN9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C19orf60Q96EN9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C19orf60Q96EN9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C19orf60Q96EN9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C19orf60Q96EN9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C19orf60Q96EN9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C19orf60Q96EN9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C19orf60Q96EN9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C19orf60Q96EN9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
C19orf60Q96EN9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C19orf60Q96EN9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C19orf60Q96EN9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C19orf60Q96EN9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C19orf60Q96EN9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C19orf60Q96EN9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C19orf60Q96EN9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C19orf60Q96EN9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C19orf60Q96EN9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C19orf60Q96EN9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C19orf60Q96EN9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C19orf60Q96EN9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C19orf60Q96EN9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C19orf60Q96EN9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C19orf60Q96EN9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C19orf60Q96EN9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C19orf60Q96EN9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C19orf60Q96EN9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C19orf60Q96EN9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C19orf60Q96EN9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C19orf60Q96EN9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
C19orf60Q96EN9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C19orf60Q96EN9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C19orf60Q96EN9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C19orf60Q96EN9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C19orf60Q96EN9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C19orf60Q96EN9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C19orf60Q96EN9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C19orf60Q96EN9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
C19orf60Q96EN9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C19orf60Q96EN9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C19orf60Q96EN9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C19orf60Q96EN9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C19orf60Q96EN9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C19orf60Q96EN9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C19orf60Q96EN9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C19orf60Q96EN9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C19orf60Q96EN9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C19orf60Q96EN9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C19orf60Q96EN9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C19orf60Q96EN9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C19orf60Q96EN9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C19orf60Q96EN9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C19orf60Q96EN9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C19orf60Q96EN9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C19orf60Q96EN9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C19orf60Q96EN9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C19orf60Q96EN9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C19orf60Q96EN9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C19orf60Q96EN9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C19orf60Q96EN9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C19orf60Q96EN9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C19orf60Q96EN9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C19orf60Q96EN9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C19orf60Q96EN9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C19orf60Q96EN9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C19orf60Q96EN9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C19orf60Q96EN9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C19orf60Q96EN9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms