Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MALSU1Q96EH3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MALSU1Q96EH3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MALSU1Q96EH3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MALSU1Q96EH3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MALSU1Q96EH3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MALSU1Q96EH3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MALSU1Q96EH3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MALSU1Q96EH3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MALSU1Q96EH3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MALSU1Q96EH3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MALSU1Q96EH3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MALSU1Q96EH3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MALSU1Q96EH3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MALSU1Q96EH3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MALSU1Q96EH3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MALSU1Q96EH3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MALSU1Q96EH3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MALSU1Q96EH3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MALSU1Q96EH3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MALSU1Q96EH3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MALSU1Q96EH3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MALSU1Q96EH3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MALSU1Q96EH3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MALSU1Q96EH3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MALSU1Q96EH3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MALSU1Q96EH3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MALSU1Q96EH3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MALSU1Q96EH3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MALSU1Q96EH3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MALSU1Q96EH3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MALSU1Q96EH3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MALSU1Q96EH3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MALSU1Q96EH3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MALSU1Q96EH3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MALSU1Q96EH3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MALSU1Q96EH3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MALSU1Q96EH3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MALSU1Q96EH3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MALSU1Q96EH3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MALSU1Q96EH3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MALSU1Q96EH3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MALSU1Q96EH3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MALSU1Q96EH3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MALSU1Q96EH3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms