Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHISA4Q96DD7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHISA4Q96DD7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHISA4Q96DD7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHISA4Q96DD7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHISA4Q96DD7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SHISA4Q96DD7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SHISA4Q96DD7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SHISA4Q96DD7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SHISA4Q96DD7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SHISA4Q96DD7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHISA4Q96DD7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHISA4Q96DD7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHISA4Q96DD7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SHISA4Q96DD7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHISA4Q96DD7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHISA4Q96DD7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHISA4Q96DD7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHISA4Q96DD7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHISA4Q96DD7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHISA4Q96DD7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHISA4Q96DD7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHISA4Q96DD7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHISA4Q96DD7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHISA4Q96DD7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHISA4Q96DD7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHISA4Q96DD7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHISA4Q96DD7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHISA4Q96DD7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHISA4Q96DD7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHISA4Q96DD7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHISA4Q96DD7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SHISA4Q96DD7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SHISA4Q96DD7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
SHISA4Q96DD7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHISA4Q96DD7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SHISA4Q96DD7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SHISA4Q96DD7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SHISA4Q96DD7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHISA4Q96DD7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHISA4Q96DD7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
SHISA4Q96DD7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
SHISA4Q96DD7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHISA4Q96DD7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SHISA4Q96DD7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SHISA4Q96DD7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHISA4Q96DD7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SHISA4Q96DD7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHISA4Q96DD7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHISA4Q96DD7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHISA4Q96DD7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
SHISA4Q96DD7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHISA4Q96DD7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SHISA4Q96DD7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SHISA4Q96DD7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHISA4Q96DD7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SHISA4Q96DD7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SHISA4Q96DD7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SHISA4Q96DD7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SHISA4Q96DD7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SHISA4Q96DD7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SHISA4Q96DD7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SHISA4Q96DD7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SHISA4Q96DD7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SHISA4Q96DD7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SHISA4Q96DD7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SHISA4Q96DD7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SHISA4Q96DD7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHISA4Q96DD7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHISA4Q96DD7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SHISA4Q96DD7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHISA4Q96DD7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHISA4Q96DD7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SHISA4Q96DD7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SHISA4Q96DD7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHISA4Q96DD7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHISA4Q96DD7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHISA4Q96DD7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SHISA4Q96DD7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHISA4Q96DD7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHISA4Q96DD7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SHISA4Q96DD7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SHISA4Q96DD7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHISA4Q96DD7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHISA4Q96DD7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHISA4Q96DD7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHISA4Q96DD7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SHISA4Q96DD7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHISA4Q96DD7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHISA4Q96DD7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SHISA4Q96DD7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SHISA4Q96DD7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SHISA4Q96DD7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SHISA4Q96DD7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SHISA4Q96DD7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SHISA4Q96DD7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SHISA4Q96DD7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHISA4Q96DD7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHISA4Q96DD7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHISA4Q96DD7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms