Protein–RNA interactions for Protein: Q96AK3

APOBEC3D, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3DQ96AK3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3DQ96AK3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3DQ96AK3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3DQ96AK3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3DQ96AK3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3DQ96AK3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3DQ96AK3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3DQ96AK3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3DQ96AK3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3DQ96AK3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3DQ96AK3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3DQ96AK3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3DQ96AK3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3DQ96AK3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3DQ96AK3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3DQ96AK3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3DQ96AK3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3DQ96AK3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3DQ96AK3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3DQ96AK3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3DQ96AK3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3DQ96AK3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3DQ96AK3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3DQ96AK3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3DQ96AK3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3DQ96AK3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3DQ96AK3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3DQ96AK3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3DQ96AK3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3DQ96AK3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3DQ96AK3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3DQ96AK3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3DQ96AK3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3DQ96AK3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3DQ96AK3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3DQ96AK3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3DQ96AK3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3DQ96AK3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3DQ96AK3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3DQ96AK3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3DQ96AK3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3DQ96AK3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3DQ96AK3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3DQ96AK3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3DQ96AK3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3DQ96AK3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3DQ96AK3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3DQ96AK3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3DQ96AK3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3DQ96AK3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3DQ96AK3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3DQ96AK3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3DQ96AK3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3DQ96AK3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3DQ96AK3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3DQ96AK3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3DQ96AK3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3DQ96AK3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms