Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC17Q96AE7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC17Q96AE7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC17Q96AE7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC17Q96AE7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC17Q96AE7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC17Q96AE7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC17Q96AE7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC17Q96AE7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC17Q96AE7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC17Q96AE7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC17Q96AE7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC17Q96AE7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC17Q96AE7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC17Q96AE7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC17Q96AE7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC17Q96AE7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC17Q96AE7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC17Q96AE7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC17Q96AE7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTC17Q96AE7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC17Q96AE7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC17Q96AE7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC17Q96AE7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC17Q96AE7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC17Q96AE7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTC17Q96AE7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TTC17Q96AE7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC17Q96AE7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC17Q96AE7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC17Q96AE7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC17Q96AE7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC17Q96AE7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTC17Q96AE7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC17Q96AE7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC17Q96AE7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC17Q96AE7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC17Q96AE7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC17Q96AE7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC17Q96AE7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC17Q96AE7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC17Q96AE7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC17Q96AE7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC17Q96AE7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC17Q96AE7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC17Q96AE7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC17Q96AE7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC17Q96AE7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC17Q96AE7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC17Q96AE7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC17Q96AE7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC17Q96AE7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC17Q96AE7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC17Q96AE7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC17Q96AE7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC17Q96AE7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC17Q96AE7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC17Q96AE7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC17Q96AE7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC17Q96AE7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC17Q96AE7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC17Q96AE7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC17Q96AE7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC17Q96AE7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC17Q96AE7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC17Q96AE7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC17Q96AE7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC17Q96AE7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC17Q96AE7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC17Q96AE7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC17Q96AE7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC17Q96AE7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC17Q96AE7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC17Q96AE7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC17Q96AE7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC17Q96AE7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC17Q96AE7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC17Q96AE7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
TTC17Q96AE7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC17Q96AE7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC17Q96AE7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC17Q96AE7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms