Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE2E3Q969T4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE2E3Q969T4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE2E3Q969T4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE2E3Q969T4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2E3Q969T4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2E3Q969T4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2E3Q969T4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2E3Q969T4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE2E3Q969T4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE2E3Q969T4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE2E3Q969T4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE2E3Q969T4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2E3Q969T4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2E3Q969T4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2E3Q969T4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2E3Q969T4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2E3Q969T4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2E3Q969T4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2E3Q969T4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2E3Q969T4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2E3Q969T4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2E3Q969T4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2E3Q969T4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2E3Q969T4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2E3Q969T4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE2E3Q969T4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE2E3Q969T4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2E3Q969T4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2E3Q969T4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3Q969T4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2E3Q969T4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2E3Q969T4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2E3Q969T4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2E3Q969T4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2E3Q969T4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2E3Q969T4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2E3Q969T4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2E3Q969T4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2E3Q969T4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2E3Q969T4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2E3Q969T4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2E3Q969T4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2E3Q969T4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2E3Q969T4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2E3Q969T4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2E3Q969T4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2E3Q969T4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2E3Q969T4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2E3Q969T4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2E3Q969T4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2E3Q969T4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2E3Q969T4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2E3Q969T4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2E3Q969T4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2E3Q969T4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3Q969T4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3Q969T4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3Q969T4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3Q969T4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2E3Q969T4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2E3Q969T4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms