Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL3LQ92901 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL3LQ92901 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL3LQ92901 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL3LQ92901 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL3LQ92901 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPL3LQ92901 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL3LQ92901 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL3LQ92901 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL3LQ92901 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL3LQ92901 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL3LQ92901 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL3LQ92901 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL3LQ92901 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL3LQ92901 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL3LQ92901 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL3LQ92901 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL3LQ92901 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL3LQ92901 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL3LQ92901 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL3LQ92901 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL3LQ92901 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL3LQ92901 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL3LQ92901 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL3LQ92901 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL3LQ92901 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL3LQ92901 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL3LQ92901 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL3LQ92901 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL3LQ92901 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL3LQ92901 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL3LQ92901 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms