Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RABGGTAQ92696 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RABGGTAQ92696 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RABGGTAQ92696 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RABGGTAQ92696 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RABGGTAQ92696 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RABGGTAQ92696 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
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