Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP5

TNFAIP8L1, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L1Q8WVP5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFAIP8L1Q8WVP5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFAIP8L1Q8WVP5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFAIP8L1Q8WVP5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFAIP8L1Q8WVP5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8L1Q8WVP5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFAIP8L1Q8WVP5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms