Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT8

SPPL2A, Signal peptide peptidase-like 2A, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL2AQ8TCT8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPPL2AQ8TCT8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPPL2AQ8TCT8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPPL2AQ8TCT8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPPL2AQ8TCT8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPPL2AQ8TCT8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPPL2AQ8TCT8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPPL2AQ8TCT8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPPL2AQ8TCT8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPPL2AQ8TCT8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPPL2AQ8TCT8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPPL2AQ8TCT8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPPL2AQ8TCT8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPPL2AQ8TCT8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPPL2AQ8TCT8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SPPL2AQ8TCT8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPPL2AQ8TCT8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPPL2AQ8TCT8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPPL2AQ8TCT8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPPL2AQ8TCT8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SPPL2AQ8TCT8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPPL2AQ8TCT8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPPL2AQ8TCT8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPPL2AQ8TCT8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPPL2AQ8TCT8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPPL2AQ8TCT8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPPL2AQ8TCT8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPPL2AQ8TCT8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL2AQ8TCT8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL2AQ8TCT8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL2AQ8TCT8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL2AQ8TCT8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL2AQ8TCT8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL2AQ8TCT8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL2AQ8TCT8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPPL2AQ8TCT8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPPL2AQ8TCT8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPPL2AQ8TCT8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPPL2AQ8TCT8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPPL2AQ8TCT8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPPL2AQ8TCT8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPPL2AQ8TCT8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPPL2AQ8TCT8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPPL2AQ8TCT8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPPL2AQ8TCT8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPPL2AQ8TCT8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPPL2AQ8TCT8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPPL2AQ8TCT8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPPL2AQ8TCT8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPPL2AQ8TCT8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPPL2AQ8TCT8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPPL2AQ8TCT8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPPL2AQ8TCT8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPPL2AQ8TCT8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPPL2AQ8TCT8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPPL2AQ8TCT8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPPL2AQ8TCT8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPPL2AQ8TCT8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPPL2AQ8TCT8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPPL2AQ8TCT8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPPL2AQ8TCT8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPPL2AQ8TCT8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPPL2AQ8TCT8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms