Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDZ2

SIMC1, SUMO-interacting motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1Q8NDZ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIMC1Q8NDZ2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIMC1Q8NDZ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIMC1Q8NDZ2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIMC1Q8NDZ2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIMC1Q8NDZ2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SIMC1Q8NDZ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIMC1Q8NDZ2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIMC1Q8NDZ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIMC1Q8NDZ2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIMC1Q8NDZ2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIMC1Q8NDZ2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SIMC1Q8NDZ2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIMC1Q8NDZ2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIMC1Q8NDZ2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIMC1Q8NDZ2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIMC1Q8NDZ2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIMC1Q8NDZ2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIMC1Q8NDZ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SIMC1Q8NDZ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIMC1Q8NDZ2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIMC1Q8NDZ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIMC1Q8NDZ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIMC1Q8NDZ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIMC1Q8NDZ2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIMC1Q8NDZ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIMC1Q8NDZ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIMC1Q8NDZ2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIMC1Q8NDZ2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIMC1Q8NDZ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIMC1Q8NDZ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIMC1Q8NDZ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIMC1Q8NDZ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIMC1Q8NDZ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIMC1Q8NDZ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIMC1Q8NDZ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIMC1Q8NDZ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIMC1Q8NDZ2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIMC1Q8NDZ2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIMC1Q8NDZ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIMC1Q8NDZ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIMC1Q8NDZ2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIMC1Q8NDZ2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIMC1Q8NDZ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIMC1Q8NDZ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIMC1Q8NDZ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIMC1Q8NDZ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIMC1Q8NDZ2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIMC1Q8NDZ2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIMC1Q8NDZ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIMC1Q8NDZ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIMC1Q8NDZ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SIMC1Q8NDZ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIMC1Q8NDZ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIMC1Q8NDZ2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIMC1Q8NDZ2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIMC1Q8NDZ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIMC1Q8NDZ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIMC1Q8NDZ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIMC1Q8NDZ2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIMC1Q8NDZ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIMC1Q8NDZ2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIMC1Q8NDZ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIMC1Q8NDZ2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIMC1Q8NDZ2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms