Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMYD1Q8NB12 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMYD1Q8NB12 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMYD1Q8NB12 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMYD1Q8NB12 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMYD1Q8NB12 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMYD1Q8NB12 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMYD1Q8NB12 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD1Q8NB12 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD1Q8NB12 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD1Q8NB12 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD1Q8NB12 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD1Q8NB12 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMYD1Q8NB12 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMYD1Q8NB12 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMYD1Q8NB12 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMYD1Q8NB12 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMYD1Q8NB12 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMYD1Q8NB12 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMYD1Q8NB12 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMYD1Q8NB12 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMYD1Q8NB12 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMYD1Q8NB12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMYD1Q8NB12 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD1Q8NB12 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD1Q8NB12 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD1Q8NB12 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD1Q8NB12 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMYD1Q8NB12 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD1Q8NB12 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD1Q8NB12 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD1Q8NB12 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD1Q8NB12 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD1Q8NB12 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD1Q8NB12 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD1Q8NB12 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD1Q8NB12 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD1Q8NB12 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD1Q8NB12 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms