Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC29Q8NA56 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC29Q8NA56 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC29Q8NA56 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC29Q8NA56 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC29Q8NA56 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC29Q8NA56 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC29Q8NA56 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC29Q8NA56 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC29Q8NA56 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC29Q8NA56 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC29Q8NA56 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC29Q8NA56 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC29Q8NA56 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC29Q8NA56 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC29Q8NA56 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC29Q8NA56 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC29Q8NA56 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC29Q8NA56 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC29Q8NA56 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC29Q8NA56 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC29Q8NA56 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC29Q8NA56 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC29Q8NA56 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC29Q8NA56 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC29Q8NA56 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC29Q8NA56 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC29Q8NA56 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC29Q8NA56 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC29Q8NA56 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC29Q8NA56 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC29Q8NA56 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC29Q8NA56 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC29Q8NA56 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC29Q8NA56 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC29Q8NA56 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC29Q8NA56 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC29Q8NA56 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC29Q8NA56 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC29Q8NA56 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC29Q8NA56 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC29Q8NA56 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC29Q8NA56 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC29Q8NA56 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC29Q8NA56 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC29Q8NA56 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC29Q8NA56 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC29Q8NA56 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC29Q8NA56 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms