Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC155Q8N6L0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC155Q8N6L0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC155Q8N6L0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC155Q8N6L0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC155Q8N6L0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CCDC155Q8N6L0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CCDC155Q8N6L0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC155Q8N6L0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC155Q8N6L0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC155Q8N6L0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC155Q8N6L0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC155Q8N6L0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC155Q8N6L0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC155Q8N6L0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC155Q8N6L0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC155Q8N6L0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC155Q8N6L0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC155Q8N6L0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC155Q8N6L0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC155Q8N6L0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC155Q8N6L0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC155Q8N6L0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC155Q8N6L0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC155Q8N6L0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC155Q8N6L0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC155Q8N6L0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC155Q8N6L0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC155Q8N6L0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC155Q8N6L0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC155Q8N6L0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC155Q8N6L0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC155Q8N6L0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC155Q8N6L0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC155Q8N6L0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC155Q8N6L0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC155Q8N6L0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC155Q8N6L0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC155Q8N6L0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC155Q8N6L0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC155Q8N6L0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC155Q8N6L0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC155Q8N6L0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC155Q8N6L0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC155Q8N6L0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC155Q8N6L0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC155Q8N6L0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC155Q8N6L0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC155Q8N6L0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC155Q8N6L0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC155Q8N6L0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC155Q8N6L0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC155Q8N6L0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC155Q8N6L0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC155Q8N6L0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC155Q8N6L0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC155Q8N6L0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC155Q8N6L0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC155Q8N6L0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC155Q8N6L0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC155Q8N6L0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC155Q8N6L0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC155Q8N6L0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC155Q8N6L0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC155Q8N6L0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC155Q8N6L0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC155Q8N6L0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC155Q8N6L0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC155Q8N6L0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC155Q8N6L0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC155Q8N6L0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC155Q8N6L0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC155Q8N6L0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC155Q8N6L0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC155Q8N6L0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC155Q8N6L0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC155Q8N6L0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC155Q8N6L0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC155Q8N6L0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms