Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5H7

SH2D3C, SH2 domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3CQ8N5H7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2D3CQ8N5H7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2D3CQ8N5H7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2D3CQ8N5H7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2D3CQ8N5H7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SH2D3CQ8N5H7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2D3CQ8N5H7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2D3CQ8N5H7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SH2D3CQ8N5H7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH2D3CQ8N5H7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH2D3CQ8N5H7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH2D3CQ8N5H7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2D3CQ8N5H7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2D3CQ8N5H7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2D3CQ8N5H7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2D3CQ8N5H7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2D3CQ8N5H7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SH2D3CQ8N5H7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SH2D3CQ8N5H7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SH2D3CQ8N5H7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH2D3CQ8N5H7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH2D3CQ8N5H7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2D3CQ8N5H7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2D3CQ8N5H7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2D3CQ8N5H7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2D3CQ8N5H7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH2D3CQ8N5H7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH2D3CQ8N5H7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SH2D3CQ8N5H7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2D3CQ8N5H7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2D3CQ8N5H7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2D3CQ8N5H7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2D3CQ8N5H7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH2D3CQ8N5H7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH2D3CQ8N5H7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH2D3CQ8N5H7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH2D3CQ8N5H7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH2D3CQ8N5H7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH2D3CQ8N5H7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH2D3CQ8N5H7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH2D3CQ8N5H7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH2D3CQ8N5H7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH2D3CQ8N5H7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SH2D3CQ8N5H7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2D3CQ8N5H7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2D3CQ8N5H7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH2D3CQ8N5H7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH2D3CQ8N5H7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH2D3CQ8N5H7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH2D3CQ8N5H7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH2D3CQ8N5H7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2D3CQ8N5H7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2D3CQ8N5H7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH2D3CQ8N5H7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2D3CQ8N5H7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2D3CQ8N5H7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2D3CQ8N5H7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2D3CQ8N5H7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2D3CQ8N5H7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2D3CQ8N5H7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2D3CQ8N5H7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2D3CQ8N5H7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2D3CQ8N5H7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2D3CQ8N5H7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH2D3CQ8N5H7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH2D3CQ8N5H7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH2D3CQ8N5H7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH2D3CQ8N5H7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH2D3CQ8N5H7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH2D3CQ8N5H7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH2D3CQ8N5H7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH2D3CQ8N5H7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH2D3CQ8N5H7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH2D3CQ8N5H7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH2D3CQ8N5H7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2D3CQ8N5H7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2D3CQ8N5H7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2D3CQ8N5H7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SH2D3CQ8N5H7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH2D3CQ8N5H7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH2D3CQ8N5H7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH2D3CQ8N5H7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH2D3CQ8N5H7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SH2D3CQ8N5H7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SH2D3CQ8N5H7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2D3CQ8N5H7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH2D3CQ8N5H7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH2D3CQ8N5H7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D3CQ8N5H7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D3CQ8N5H7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH2D3CQ8N5H7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SH2D3CQ8N5H7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2D3CQ8N5H7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2D3CQ8N5H7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2D3CQ8N5H7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2D3CQ8N5H7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH2D3CQ8N5H7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SH2D3CQ8N5H7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SH2D3CQ8N5H7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SH2D3CQ8N5H7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms