Protein–RNA interactions for Protein: Q8N587

ZNF561, Zinc finger protein 561, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF561Q8N587 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF561Q8N587 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF561Q8N587 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF561Q8N587 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF561Q8N587 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF561Q8N587 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF561Q8N587 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF561Q8N587 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF561Q8N587 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF561Q8N587 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF561Q8N587 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF561Q8N587 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF561Q8N587 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF561Q8N587 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF561Q8N587 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF561Q8N587 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF561Q8N587 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF561Q8N587 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF561Q8N587 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF561Q8N587 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF561Q8N587 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF561Q8N587 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF561Q8N587 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF561Q8N587 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF561Q8N587 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF561Q8N587 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF561Q8N587 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF561Q8N587 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF561Q8N587 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms