Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFRP1Q8N474 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFRP1Q8N474 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFRP1Q8N474 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SFRP1Q8N474 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFRP1Q8N474 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFRP1Q8N474 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SFRP1Q8N474 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFRP1Q8N474 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFRP1Q8N474 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SFRP1Q8N474 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SFRP1Q8N474 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFRP1Q8N474 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SFRP1Q8N474 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SFRP1Q8N474 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SFRP1Q8N474 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SFRP1Q8N474 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SFRP1Q8N474 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SFRP1Q8N474 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SFRP1Q8N474 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SFRP1Q8N474 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SFRP1Q8N474 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SFRP1Q8N474 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SFRP1Q8N474 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SFRP1Q8N474 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SFRP1Q8N474 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SFRP1Q8N474 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SFRP1Q8N474 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SFRP1Q8N474 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SFRP1Q8N474 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SFRP1Q8N474 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SFRP1Q8N474 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SFRP1Q8N474 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFRP1Q8N474 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFRP1Q8N474 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFRP1Q8N474 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFRP1Q8N474 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SFRP1Q8N474 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFRP1Q8N474 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SFRP1Q8N474 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFRP1Q8N474 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SFRP1Q8N474 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFRP1Q8N474 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFRP1Q8N474 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFRP1Q8N474 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFRP1Q8N474 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFRP1Q8N474 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFRP1Q8N474 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFRP1Q8N474 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFRP1Q8N474 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFRP1Q8N474 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFRP1Q8N474 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFRP1Q8N474 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFRP1Q8N474 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFRP1Q8N474 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFRP1Q8N474 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFRP1Q8N474 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFRP1Q8N474 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFRP1Q8N474 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms