Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA5B2Q8N398 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA5B2Q8N398 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA5B2Q8N398 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA5B2Q8N398 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA5B2Q8N398 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA5B2Q8N398 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA5B2Q8N398 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA5B2Q8N398 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA5B2Q8N398 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA5B2Q8N398 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA5B2Q8N398 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA5B2Q8N398 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA5B2Q8N398 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA5B2Q8N398 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA5B2Q8N398 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VWA5B2Q8N398 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VWA5B2Q8N398 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VWA5B2Q8N398 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VWA5B2Q8N398 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VWA5B2Q8N398 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA5B2Q8N398 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VWA5B2Q8N398 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VWA5B2Q8N398 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VWA5B2Q8N398 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VWA5B2Q8N398 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA5B2Q8N398 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA5B2Q8N398 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA5B2Q8N398 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA5B2Q8N398 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA5B2Q8N398 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA5B2Q8N398 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA5B2Q8N398 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA5B2Q8N398 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA5B2Q8N398 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA5B2Q8N398 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA5B2Q8N398 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA5B2Q8N398 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA5B2Q8N398 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA5B2Q8N398 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA5B2Q8N398 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA5B2Q8N398 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA5B2Q8N398 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA5B2Q8N398 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA5B2Q8N398 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA5B2Q8N398 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA5B2Q8N398 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA5B2Q8N398 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA5B2Q8N398 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA5B2Q8N398 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA5B2Q8N398 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA5B2Q8N398 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA5B2Q8N398 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA5B2Q8N398 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA5B2Q8N398 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA5B2Q8N398 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA5B2Q8N398 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VWA5B2Q8N398 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms