Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT78Q8N1N4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT78Q8N1N4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT78Q8N1N4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT78Q8N1N4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT78Q8N1N4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT78Q8N1N4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT78Q8N1N4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT78Q8N1N4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT78Q8N1N4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT78Q8N1N4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT78Q8N1N4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT78Q8N1N4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT78Q8N1N4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT78Q8N1N4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT78Q8N1N4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT78Q8N1N4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT78Q8N1N4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT78Q8N1N4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT78Q8N1N4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT78Q8N1N4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT78Q8N1N4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT78Q8N1N4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT78Q8N1N4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT78Q8N1N4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT78Q8N1N4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT78Q8N1N4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT78Q8N1N4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT78Q8N1N4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT78Q8N1N4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT78Q8N1N4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT78Q8N1N4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT78Q8N1N4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT78Q8N1N4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT78Q8N1N4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT78Q8N1N4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT78Q8N1N4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT78Q8N1N4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT78Q8N1N4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT78Q8N1N4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT78Q8N1N4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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