Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN4BQ8IWT1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN4BQ8IWT1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN4BQ8IWT1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN4BQ8IWT1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN4BQ8IWT1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN4BQ8IWT1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN4BQ8IWT1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN4BQ8IWT1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCN4BQ8IWT1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCN4BQ8IWT1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCN4BQ8IWT1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCN4BQ8IWT1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN4BQ8IWT1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN4BQ8IWT1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN4BQ8IWT1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN4BQ8IWT1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN4BQ8IWT1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN4BQ8IWT1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN4BQ8IWT1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN4BQ8IWT1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN4BQ8IWT1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN4BQ8IWT1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN4BQ8IWT1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN4BQ8IWT1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN4BQ8IWT1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN4BQ8IWT1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCN4BQ8IWT1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SCN4BQ8IWT1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN4BQ8IWT1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN4BQ8IWT1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN4BQ8IWT1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN4BQ8IWT1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN4BQ8IWT1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN4BQ8IWT1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN4BQ8IWT1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN4BQ8IWT1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCN4BQ8IWT1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN4BQ8IWT1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms