Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUY3

GRAMD2A, GRAM domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2AQ8IUY3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD2AQ8IUY3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD2AQ8IUY3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD2AQ8IUY3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD2AQ8IUY3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD2AQ8IUY3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD2AQ8IUY3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD2AQ8IUY3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD2AQ8IUY3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD2AQ8IUY3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD2AQ8IUY3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD2AQ8IUY3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRAMD2AQ8IUY3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRAMD2AQ8IUY3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD2AQ8IUY3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD2AQ8IUY3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD2AQ8IUY3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD2AQ8IUY3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD2AQ8IUY3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRAMD2AQ8IUY3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRAMD2AQ8IUY3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRAMD2AQ8IUY3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRAMD2AQ8IUY3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRAMD2AQ8IUY3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRAMD2AQ8IUY3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD2AQ8IUY3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD2AQ8IUY3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRAMD2AQ8IUY3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD2AQ8IUY3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD2AQ8IUY3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD2AQ8IUY3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD2AQ8IUY3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD2AQ8IUY3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD2AQ8IUY3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD2AQ8IUY3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD2AQ8IUY3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD2AQ8IUY3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRAMD2AQ8IUY3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRAMD2AQ8IUY3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD2AQ8IUY3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD2AQ8IUY3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRAMD2AQ8IUY3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRAMD2AQ8IUY3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms